原子吸收分光光度法是基于基態(tài)原子對共振光的吸收；而原子熒光光度是處于激發(fā)態(tài)原子向基態(tài)躍遷，并以光輻射形式失去能量而回到基態(tài)。而且這個激發(fā)態(tài)是基態(tài)原子對共振光吸收而躍遷得來的。因此，原子熒光包含了兩個過程：吸收和發(fā)射。

　　色散系統(tǒng)：較之原子吸收熒光譜線更少，光譜干擾也少，所以可以用低分辨力的分光系統(tǒng)甚至于非色散系統(tǒng)。

　　光學排列：對于原子吸收，檢測器必須觀察初級光源（HCL），因為需要測量的是原子對光源特征輻射的吸收；而原子熒光的光學排列與原子吸收不同，往往要避開初級光源的直接射入，而以一定角度去觀察原子化器，測定其向2pi立體角輻射的熒光。在有的資料上可以看到rightangleview(直角觀察)和frontview(正面觀察)這樣的光學排列。

　　大多數(shù)AFS分析的元素，原子吸收都很難做，所以有人稱其為原子吸收的好朋友，原子吸收的補充。

　　原子熒光和原子吸收都是光譜，原理稍微有些不同。原子熒光的特長是測量As，Se，Hg等一些過度元素和特殊的金屬元素。原子吸收分火焰和石墨爐兩種，主要測量重金屬元素，石墨爐原子吸收測量重金屬元素也可以達到ug/L級別。原子熒光和原子吸收在實驗室里沒有ICPMS的情況下作為互補，可以測量大部分金屬元素和過度元素。具體誰更有*性，檢測限更低要根據(jù)具體的元素來定。